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学术文章丨基于dPCR的病毒抗原和核酸检测通用标准品建立

发布日期:2025-12-19

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近日,由中国食品药品检定研究院首都医科大学附属北京地坛医院、清华大学等多单位联合在《Virology Journal》期刊发表重要研究成果。研究以新冠病毒为基础,通过β-丙内酯(BPL)灭活处理,结合多实验室联合定值,成功建立基于数字PCR(dPCR)技术的新冠病毒抗原与核酸通用标准,首次实现了抗原快速检测核酸扩增检测LoD性能的直接跨方法比较,为新冠检测试剂的性能评估提供了“统一标尺”也为其他病毒检测试剂的性能评价提供了参考



研究背景


新冠诊断中,抗原快速检测因快速、低成本广泛应用,核酸扩增检测因高灵敏度被视为“金标准”,但两大检测体系长期面临三大痛点:

  • 抗原定量无标准:核酸可通过“拷贝数”精准定量,而抗原缺乏公认的标准化单位,导致抗原检测的分析性能(尤其是LoD)难以精准评估

  • 检测方法难对比:不同灭活方法(加热、γ辐射、BPL等)和病毒滴度单位(PFU/mL、TCID50/mL等)不统一,抗原快速检测核酸扩增检测的灵敏度无法直接比较;

  • 标准缺失影响决策:早期新冠疫情期间,WHO尚未建立抗原国际标准,且临床中抗原结果与核酸载量的关联需进一步验证,影响试剂选型和公共卫生策略制定。



研究目的


  • 建立基于数字PCR的新冠病毒抗原和核酸通用标准,解决抗原定量无统一单位的问题;

  • 优化灭活方法(加热 vs. BPL灭活),明确其对核酸检测和抗原活性的影响;

  • 验证该标准在抗原快速检测和核酸扩增检测LoD评估中的适用性,实现两种检测方法的灵敏度跨方法对比。



研究方法


  • 采集10例新冠感染者不同感染时间咽拭子,用2种抗原试剂盒(免疫层析法)和5种核酸试剂盒(dPCR、qPCR、等温扩增等)检测。

  • 对新冠毒株培养物用不同方法灭活,通过dPCR、qPCR、测序等分析影响,制备标准候选物并冻干。

  • 7家实验室用5种dPCR平台定值,评估7种抗原与7种核酸试剂盒LoD,SPSS统计分析(P<0.05有意义)。



研究结果


※ 临床样本:抗原阳性与高核酸滴度强关联

4种核酸试剂盒一致性好,等温微流控芯片法试剂盒E灵敏度较低;抗原试剂盒G优于F,抗原结果与核酸滴度存在显著相关性,为标准建立的“抗原和核酸关联逻辑”提供临床依据。


※ 灭活方法:BPL灭活优势显著

BPL灭活对核酸和抗原检测影响更小,优于热灭活,解决了“灭活影响抗原检测准确性”的难题。BPL灭活样本在dPCR、qPCR和测序中表现无影响。


 标准品定值:1.04×10⁸ U/mL,1U=1个核酸拷贝
7个实验室的dPCR检测结果高度一致(ORF1ab基因CV=3.5%,N基因CV=2.1%),最终确定标准品浓度为1.04×10⁸ U/mL(标准不确定度3.48×10⁶ U/mL),其中“1 U”通过dPCR精准定义为“1个新冠病毒核酸拷贝”,同时基于“每个病毒颗粒含26个核衣壳蛋白(N蛋白)”的研究结论,间接实现抗原定量关联。
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 检测限对比:核酸扩增检测更灵敏,部分特定方法的抗原检测接近“金标准”

灵敏度范围:通过dPCR标准化评估,核酸扩增检测的LoD为10²-10⁴U/mL,抗原快速检测为10⁴-10⁶U/mL,临床用试剂灵敏度普遍高于家用试剂;
方法差异:抗原快速检测中,化学发光法灵敏度最优;核酸扩增检测中,dPCR和RT-PCR灵敏度优于mNGS和LAMP;
试剂达标率:多数商用试剂达到宣称LoD,且核酸扩增检测的宣称值与实测值差距均在2倍以内,验证了dPCR标准化评估的可靠性。
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总结与讨论


该研究建立的意义
● 填补标准空白:首次建立新冠抗原和核酸通用标准,为监管机构提供试剂审评和监管的统一依据,帮助企业优化产品性能(如标注“基于国标 U/mL 的 LoD”);

● 指导公共卫生决策:明确抗原快速检测与核酸扩增检测的灵敏度差异,为“高风险场景(如医院)用核酸扩增检测、大规模筛查用抗原快速检测”的策略提供数据支撑,尤其在变异株流行时(如Omicron),可通过及时研制变异株标准快速评估试剂适用性;

● 技术可推广性:该基于dPCR的标准建立思路,可延伸至流感、RSV等其他呼吸道病毒,为新发传染病早期检测标准化提供参考。


该研究为新冠检测标准化提供了里程碑式解决方案,也为其他呼吸道病毒(如流感、RSV)的诊断标准建立提供了参考。


原文链接:

https://doi.org/10.1186/s12985-025-02954-w



●关于新羿生物●

新羿生物成立于2015年,位于中关村科技园,是国家高新技术企业、北京市“专精特新”企业,专注于生命科学与分子诊断的自主创新,拥有在仪器、芯片、材料、试剂、软件等领域的高水平研发团队。公司发展迅速,申请国内外专利200余项、授权专利150余项,持续在权威期刊发表学术论文,承担国家级科研基金。公司基于自主知识产权的数字PCR技术,已获得首个及第二个共三项数字PCR仪NMPA III类医疗器械注册证,三项诊断试剂NMPA III类医疗器械注册证,其中感染和实体瘤液体活检领域均为首个数字PCR诊断试剂III类注册证,两次获得中国体外诊断优秀创新产品金奖,荣获中关村国际前沿科技创新大赛总冠军,荣获北京市科学技等奖和发明创业成果奖。公司自主研发的开放式分子POCT一体机及qPCR快检试剂均获NMPA III类医疗器械注册证。公司秉承“创新,让精准触手可及”的理念,发展多指标、高通量、自动化、防污染、成本低的先进技术,致力于成为领先的生命科学和分子诊断企业,服务于生命科学、精准医疗、药物开发及健康管理。

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